Bienvenidos a la prueba de GIT!!!

El script RUNClustering.R es el que realiza el clustering jerarquico. Recibe como entrada un data set que tiene que tener las siguientes caracteristicas (VER ARCHIVO DataSet_ejemplo):

- Se deben respetar los nombres de los encabezados de las columnas y ademas la separación por ";"
- Se deben realizar los alineamientos de todos los decoys + conformeros CODNAS en forma no redundante, es decir, si tenemos:
A1
A2
A3
A4

Las comparaciones podrían ser:
A1-A2
A1-A3
A1-A4
A2-A3
A2-A4

También podria cambiar el orden en el par, ya que los RMSD van a dar lo mismo.

Para ejecutarlo al script se hace:

R CMD -vanilla RUNClustering.R

En un mismo archivo se pueden tener los alineamientos de los decoys de distintos targets, siemrp y cuando en la columna Target se ponga a que target de CASP pertenece ese par, el programa sabra diferenciar que debe clusterizar e ira generando dos archivos, uno con la informacion de los clusters en un .txt y otro va a ser el .png con la imagen