Issues with gatk-test-data

[mwiewior]

➜ samtools view NA12878_24RG_small.hg38.md.bam| grep "HK35MCCXX160204:6:2111:27194:55350"
HK35MCCXX160204:6:2111:27194:55350      81      chr1    10330   0       6S23M1I25M1I65M30S      chr18   10294   0       CCCCCCCCCCTAACCCCACCCCTAACCCTCACCCTAACCCTAACCCTACCCCTAACCCCTAACCCTAACCCCTACCCCCTAACCCTAACCCTAACCCTAACCCTAACCCTAACCCTAACCCGAACCCGAACCCGAACCCGAACCCGAACCC #########################???0++:;5+++??5+5+???++'????+5?!$'5+???5+++???5?+'??????+????5???????????????????????????????5&#?????????????????????????????? SA:Z:chr13,114353980,+,6M1D33M1D12M100S,0,2;    MC:Z:7M4D7M1I21M1D59M56S        MD:Z:10T1A28A24A46      PG:Z:MarkDuplicates     RG:Z:HK35M.6    NM:i:6  MQ:i:0  UQ:i:22 AS:i:79 ZQ:Z:@@@@@@@@@@@@@@@@@@@@@@@@@@@@E@@ED@@@@@@@@@@@@@@@@@@@@@@@^[N@@@@@@@@@@@@@@@@@@@@@@@@@@@@@@@@@@@@@@@@@@@@@@@@@@@@@@@@@@@JY\@@@@@@@@@@@@@@@@@@@@@@@@@@@@@@

Caused by: java.lang.Exception: Something wrong with HK35MCCXX160204:6:2111:27194:55350 read, 151, ReadQualSummary(10256,10396,[B@4503395,CigarDerivedConf(true,true,true,5,InDelPositions(Set(10339, 10402),Set(10311, 10312, 10313, 10314, 10315, 10316, 10364)))), 151