Este projeto tem o intuito de investigar a diversidade viral na microbiota de bovinos que foram criados a partir de dois sistemas de manejos diferentes: extensivo, e o intensivo. Para realizarmos este estudo, utilizamos os dados metagenômicos apresentados no artigo intitulado "Taxonomy and Functional Diversity in the Fecal Microbiome of Beef Cattle Reared in Brazilian Traditional and Semi-Intensive Production Systems" que foram coletados de 60 bovinos machos de seis fazendas no Brasil. Essas fazendas representam dois sistemas de produção de carne bovina: o intensivo e o tradicional. O estudo utilizou a técnica de sequenciamento Ilumina para caracterizar a composição taxonômica e funcional do microbioma fecal dos animais.
O arquivo principal de análise é o AnalysisNotebook.ipynb. Neste arquivo estão boa parte dos scripts para criação dos DataFrames, e manipulação dos mesmos.