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Développement d’une IA permettant d’identifier les différences morphologiques entre tumeurs de la plèvre avec différentes altérations moléculaires grâce à l’analyse des images histologiques.

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tchalas1/Projet-5BIM-CLB_Mesopath

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Projet 5BIM

Implémentation de modèles d'IA état de l'art pour l'encodage d'images histopathologiques de tumeurs de la plèvre puis analyse de leur efficacité dans la classification de ces tumeurs en fonction de leur état BAP 1 (exprimé ou non).

Environnements nécessaires

Les différentes méthodes et analyses produites par ces codes requèrent l'installation de différents environnements : gigassl, conch, titan et clam qui sont installable aux liens suivants :
-https://github.com/trislaz/Democratizing_WSI
-https://github.com/mahmoodlab/CONCH/tree/main
-https://github.com/mahmoodlab/TITAN?tab=readme-ov-file
-https://github.com/mahmoodlab/CLAM

Chemins

Tous les chemins pointant vers des fichiers ou dossiers des scripts python et des notebooks doivent être modifiés selon l'utilisation faite.

About

Développement d’une IA permettant d’identifier les différences morphologiques entre tumeurs de la plèvre avec différentes altérations moléculaires grâce à l’analyse des images histologiques.

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